Johannes Kastajan saaren rakennuksista, joiden puinen kirkko on Valamon vanhin puurakennus, vain kirkko ja ruokalarakennus ovat säilyneet. Kirkko siirrettiin Valamoon 1858 Laatokan eteläpuolella sijainneesta Vasilin luostarista, missä kirkon rakentanut veljestö oli ollut sotaa ja ruotsalaisia paossa 1600-luvulla. Veljestöä varten on rakennettu uusi asuinrakennus sekä erakkomunnkien majoja. Kirkon kunnostustyöt saatiin valmiiksi 2004. Saaren korkealla rantapenkereellä seisova kivinen muistoristi näkyy avomerelle luoteeseen. Naisten pääsy saarelle, jonka skiitassa ja majoissa asui erakkomunkkeja, oli ja on nykyisinkin kielletty. Saarelle ei järjestetä ulkopuolisten vierailuja.